Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11455/22214
標題: 藍綠藻台灣分離株rbcLXS及hupSL基因串核酸及胺基酸序列之比較分析
Analysis and Comparison of rbcLXS and hupSL Gene Locus Nucletide and Amino Acid Sequences of the Taiwan Isolated Cyanobacterium
作者: 鐘惠橋
Chung, Hui-chiao
關鍵字: gene;基因;cyanobacterium;phylogenetic analysis;RuBP;hydrogenase;藍綠藻;譜系關係;核酮醣二磷酸;氫酵素
出版社: 植物學系
摘要: 
利用從魚腥藻PCC 7120 rbcLS基因兩端高保留區設計兩條引子,篩選魚腥藻CH1 Rubisco基因rbcLXS,以CH1基因體組DNA為模版 (template), 進行PCR反應,所得PCR產物經核酸定序得知,包含rbcL、rbcX及rbcS三個基因,其中rbcL基因含1428個鹼基對,可轉譯出476個胺基酸的蛋白,分子量52.9 kDa;rbcS基因含330個鹼基對,可轉譯出109個胺基酸,分子量12.9 kDa;rbcX基因含399個鹼基對,可轉譯出132個胺基酸的蛋白,分子量15.2 kDa。
依據Kellogg及Juliano (1997) 結果,推測魚腥藻CH1 RbcL活化區位於其α螺旋體與β平板所形成的C端loop處且胺基酸具有100%高保留特性。有關rbcX研究,截至目前為止,rbcX基因只在藍綠藻發現。
選殖魚腥藻CH2氫酵素基因hupSL過程,首先以魚腥藻CH1氫酵素基因hupSL為探針,經南方墨點分析結果,發現hupSL在魚腥藻CH2基因體組內為single copy。以魚腥藻CH2基因體組DNA切EcoR I 5.3 kb處構築而成的基因庫中篩選,將得到的選殖體核酸定序分析,包含完整的hupS基因963個鹼基對,可轉譯出320個胺基酸,分子量35.2 kDa;及hupL片段前端511個鹼基對;以及hupS前端未轉譯區2874個鹼基對;及hupL基因內插入片段841個鹼基對。將此片段進行基因庫比對,並無相似的片段存在,推論魚腥藻CH2 hupL基因具有基因重組現象。
魚腥藻CH1及CH2譜係關係分析,經由hupS、hupL核酸及胺基酸序列親緣關係比較,魚腥藻CH2與念珠藻PCC 73102親緣關係上較魚腥藻CH1、PCC 7120近,其可信度100%。與紫細菌親緣關係,由核酸及胺基酸序列比較,魚腥藻與紫細菌氫酵素基因差異很大。魚腥藻CH1譜係關係分析,經rbcL、X、S核酸及胺基酸序列親緣關係比較,所得結果,魚腥藻CH1與PCC 7120親緣關係較近,此結果與hupS、hupL核酸及胺基酸序列親緣關係分析結果一樣,藍綠藻親緣分析氫酵素基因hupS、hupL可以作為藍綠藻親緣分析上的研究。
URI: http://hdl.handle.net/11455/22214
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