Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11455/92633
標題: 利用ISSR分子標誌研究藥用真菌桑黃之族群多樣性
Study on population diversity of medicinal fungus Sanghuangporus sanghuang by using ISSR molecular markers
作者: 陳愉萍
Yu-Ping Chen
關鍵字: 桑黃;分子標誌;ISSR;遺傳分化;基因流;遺傳變異;UPGMA;Sanghuangporus sanghuang;molecular markers;ISSR;genetic diversity;gene flow;genetic variation;UPGMA
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摘要: 
桑黃隸屬於擔子菌門 (Basidiomycota)、刺革菌目 (Hymenochaetales)、刺革菌科 (Hymenochaetaceae)、桑黃屬 (Sanghuangporus),為重要藥用真菌。藉由採集自中國、日本、韓國以及台灣地區37株桑黃子實體或菌種,應用分析Internal transcribed spacer rDNA (ITS,包含ITS1、5.8S、ITS2)片段、Large subunit rDNA (28S rDNA)、Mitochondrial Small rDNA (MS)基因片段以及簡單重複序列 (Inter-Simple Sequence Repeat, ISSR)分子標誌,進行族群遺傳及物種起源路徑探討研究。
初步分析Internal transcribed spacer rDNA (ITS,包含ITS1-5.8S-ITS2)、Large subunit rDNA (28S rDNA)與Mitochondrial Small rDNA (MS)基因片段,所得結果顯示,由於序列間變異性不足,這些基因片段不適合用來研究桑黃族群分化。因此,本研究採用ISSR分子標誌技術進行這項研究。從100條ISSR引子中篩選出產生增幅條帶具多型性且再現性良好的6條引子。利用6條ISSR引物進行PCR試驗,每一引物擴增獲得的ISSR條帶數在3 ~ 14條之間,擴增片段集中在300 bp ~ 3,000 bp。基於遺傳相似性系數(GSt)、基因流 (Nm)、不加權成對群算術平均法(UPGMA)構建的譜系樹分析。結果顯示,同一族群樣本間的遺傳分化較小,不同地域的樣本間存在著較大的遺傳多樣性。分子變方分析 (AMOVA) 結果顯示,華西南、華中-華東南-台灣與華東北-韓國-日本產之桑黃區域間的變方成分為74%,而區域內族群間之變方成分為68%。不分區域之族群間的變方成分為65%,近二倍於族群內個體間的變方成分(35%)。顯示族群個體之變異主要來自族群間。族群遺傳分析POPGENE結果顯示族群具有中偏低之基因歧異度值 (H為0.1679)、較高之遺傳分化 (Gst為0.5129)及較低基因流 (Nm為0.4748),這現象顯示族群基因流受到限制,地區之間有交流障礙,受地理阻礙,與地理分布狀況相關,因此有中等偏低的基因歧異度與較高分化之遺傳結構。桑黃族群的遺傳距離矩陣及地理距離矩陣所進行相關性測驗,結果顯示桑黃之族群變異與地理距離有顯著關係。根據基因組多態性分析及歸群分析,四川、西藏的遺傳多樣性分別為0.1139、0.1132,高於其它地區,推測四川、西藏有較古老祖先型桑黃。依據族群遺傳變異之歸群與主座標分析結果,可將桑黃區分為華西南、華中-華東南-台灣與華東北-韓國-日本三個族群。各地族群之分化應該是受地理阻隔的影響。
URI: http://hdl.handle.net/11455/92633
其他識別: U0005-2308201523523200
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